Sistem dan penyelenggaraan Pendidikan mengacu kepada Kurikulum Nasional Program Diploma (D3) Bidang ilmu-ilmu Pertanian (KepmenDikbud No. 080/U/1998). Materi Kurikulum disesuaikan dengan perkembangan/kemajuan Ilmu dan Teknologi (IPTEK), serta tuntutan masyarakat maupun pemakai jasa. Pelaksanaan kurikulum berdasarkan paket Sistem Kredit Semester (SKS) yang harus ditempuh oleh mahasiswa dalam 6 (enam) semester, dengan jumlah SKS antara 110-120.

Kegiatan belajar mengajar terdiri atas teori (kuliah) sebesar 40 % dan praktikum sebesar 60%. Kegiatan praktikum meliputi : Praktek Laboratorium, Workshop, Praktek Lapang, Studi Lapang, PKPM (Pengalaman Kerja Praktek Mahasiswa) diberbagai perusahaan Swasta maupun Instansi Pemerintah dan proyek usaha mandiri. Lokasi Kampus yang nyaman untuk belajar dan terletak di perkotaan. Bagi mahasiswa yang berprestasi tersedia beasiswa baik dari Pemerintah maupun swasta.

Kegiatan belajar mengajar ini sebagai perwujudan dan upaya mencapai tujuan umum Pendidikan Politeknik Pertanian yaitu untuk mencetak tenaga Profesional dalam bidang pertanian yang mampu menghadapi segala tantangan di lapangan berdasarkan pengetahuan dan keterampilan yang dimilikinya.

Untuk mencapai tujuan tersebut program pendidikan di Politeknik Pertanian Negeri Jember didukung oleh staf pengajar dan instruktur dari akademisi bergelar Ahli Madya (A.Md), Sarjana (S1) dan Magister (S2) yang telah berpengalaman, serta dilengkapi sarana dan prasarana laboratorium yang lengkap dan modern, serta kebun koleksi berbagai jenis tanaman di atas 25 Ha lahan praktek yang representatif.

Lulusan Politeknik Pertanian mendapatkan sebutan profesional Ahli Madya (A.Md), yang dibutuhkan untuk mengisi pembangunan pertanian pada tingkat kemahiran yang lebih tinggi. Peluang kerja dalam bidang Agribisnis dan Agroindustri masih terbuka lebar serta memiliki prospek yang cerah. Disamping itu wawasan keunggulan yang berkualitas dan bekal ilmu maupun ketrampilan yang didapatkan, lulusan yang dihasilkan juga mampu berusaha secara mandiri (wirausaha).

Kompetensi Lulusan Politeknik Pertanian Negeri Jember :

• Beriman dan bertaqwa terhadap Tuhan Yang Maha Esa dan berjiwa Pancasila

• Memiliki integritas kepribadian yang tinggi

• Terbuka dan tanggap terhadap perubahan kemajuan Ilmu Pengetahuan, Teknologi dan / atau Seni (IPTEK), serta masalah yang dihadapi masyarakat, khususnya yang berkaitan dengan pelayanan langsung dalam bidang Agribisnis dan Agroindustri.

• Menguasai kemampuan dalam bidang kerja yang bersifat rutin maupun tidak rutin secara mandiri dalam bidang Agribisnis dan Agroindustri.

• Mampu melakukan pengawasan dan bimbingan serta mempunyai ketrampilan manajerial dalam bidang Agribisnis dan Agroindustri.